第三項教義，任何知道自己是人的人都不會質疑；但為了理解它以及其餘的教義，我們必須思考「靈魂」（spirit）在此處的含義。此處的「靈魂」只能是指理性靈魂，它是構成人最主要的成分。因為雖然這個詞有時指風或氣息，有時指道德與智力的素質，且有其他多種含義，但我無需在此證明它在此處並非如此。司提反並非祈求基督接納他的氣息、他的恩典或聖靈，而是接納他那理性的、不朽的靈魂。
不僅是靈魂，連上帝本身也被稱為「靈」（Spirit）；雖然這個名稱源自較低層次的事物，那是因為我們對上帝或靈體沒有充分的正面概念，因此我們無法為它們取到充分且恰當的名稱，而必須借用名稱，以回應我們的觀念。
有時「靈」（如來四12等處）與「魂」有所區別；那時它要麼指同一靈魂中較高層次的官能，要麼指被恩典提升後的同一靈魂。
你問：「靈魂是什麼？」你也可以問：「人是什麼？」若人不知道人是什麼，那真是可悲。它是我們的智性本質，也包含了感官與植物性的生命。它是我們藉以生活、感覺、理解並自由意志運作的主要或第一行動。行動告訴你官能或能力是什麼，從而告訴你靈魂是什麼。如果你知道理智、理性與自由意志是什麼，你就能知道擁有靈性本質是什麼意思，這本質本質上包含了推理與意志的能力。正是你的靈魂使你能夠思考並詢問靈魂是什麼；正如那推理以證明人沒有理性的人，藉由反對理性的推理，反而證明了他擁有理性；同樣地，那推理以證明自己沒有靈魂的人，也藉此證明了他擁有一個（儘管被濫用的）理性靈魂。
然而，有些人盲目到質疑自己是否有靈魂，因為他們看不見靈魂；然而，如果他們能用肉眼看見靈魂，那它就不是靈魂了，因為靈體是不可見的。他們看不見空氣或風，但他們知道空氣或風的存在。他們看不見上帝或天使，但如果他們懷疑上帝與天使是否存在，他們確實是愚昧人。如果他們看不見自己的眼睛，他們仍知道自己有眼睛，因為他們藉著這些眼睛看見了其他事物。如果他們不能直接且直覺地知道自己有理性靈魂，他們也可以藉由自己對其他事物的認知來得知，因為若沒有這樣的靈魂，這些事物是無法被認知的。上帝對那些生活得如此肉體、如此獸性、如此疏忽，彷彿沒有靈魂需要使用或照顧的人，最終任憑他們去質疑自己是否有靈魂，這是公義的。
哦，可悲的墮落！敗壞的本性！哦，可憐的人們，你們離棄上帝已遠，以至於否定了自己也否定了上帝！或者質疑上帝是否為上帝，人是否為人。回到上帝那裡，你就會回到你自己。人啊，不要忘記你高貴的本性，你最主要的部分：不要因為你看不到殼裡的東西，就以為你只是個殼。當靈魂還在肉體中時，是靈魂藉由身體在交流。我正在對你的靈魂說話，而你的靈魂正在理解我。當你的靈魂離去，我將不再對你說話。你的靈魂是上帝以直接或特殊的方式所造的工。「我所造的靈魂。」（賽五十七16）「祂將生氣吹在他鼻孔裡，他就成了有靈的活人。」（創二7）你的靈魂被稱為是照著上帝的形象所造的；因為你被賦予了廣闊的理解力與自由意志；而你的靈魂正是祂道德形象——即屬靈的智慧、公義與聖潔——的直接主體。上帝沒有像你身體那樣的手、腳或其他肢體。那種不僅能（在自身限度內）認識世上萬物，更能認識上帝與來世事物的本質，是何等高貴！它有能力愛上帝、享受上帝，並為了那種享受而尋求與事奉祂！當基督為罪獻上祂的靈魂作為祭物時，祂並沒有輕視靈魂，祂以如此重價救贖了靈魂（賽五十三10）。若非為了我們不朽的靈魂，上帝會以如此關係尊榮我們，使我們成為祂的兒女嗎？（因為祂首先是靈的父（來十二9），然後才是聖徒的父。）我們應被稱為基督的新婦與肢體嗎？祂會在我們身上花費如此大的代價嗎？如果我們沒有適合事奉上帝的靈，天使會作為服役的靈來服事我們嗎？上帝的靈本身會住在我們裡面，並以祂的恩典使我們活過來、使我們美麗嗎？如果我們只是一群聰明的野獸，而沒有理性的、不朽的靈魂，世界上的萬物（其物質本體似乎與我們一樣卓越）會來服事我們嗎？如果我們沒有靈魂需要拯救或失去，會為我們預備如此多的恩典嗎？會預備牧者來傳道、禱告並為我們勞苦嗎？「他們為你們的靈魂警醒，好像那將來交帳的人。」（來十三17）他們若不是知道「智慧人必能得人」（箴十一30），且「叫一個罪人從迷路上轉回，便是救一個靈魂不死，並且遮蓋許多的罪」（雅五20），為什麼要務要傳道，無論得時不得時，並受如此多的苦來完成他們的工作呢？魔鬼自己也會告訴你靈魂的價值，當牠遍行全地（伯一7），晝夜尋找機會欺騙並吞吃靈魂時（彼前五8），牠卻能讓你相信靈魂毫無價值，以至於可以被濫用於最卑賤的苦役，被罪與感官享樂所毒害，為虛無之物冒險？
哦，先生們，你們擁有如此不朽的靈魂，難道要為了私慾、為了獸性的享樂、為了放縱肉體的自由，或者為了猶大出賣他主人的代價而將其出賣嗎？你的靈魂難道不比榮耀、財富或愚蠢的歡樂更有價值嗎？你的靈魂難道卑賤到不值得為聖潔的生活付出關懷與勞苦嗎？世界值得你所有的關懷與勞苦，而當這是為了你寶貴的靈魂時，卻被稱為小題大作嗎？唉！看著許多人那疏忽、肉體的生活，人們會以為他們不記得自己有靈魂。在他們深度的安全感中，在他們野心的巔峰，在肉體私慾的熱潮中，難道不需要一個監護人呼喚他們：「記住你是個人，你有一個靈魂需要拯救或失去」嗎？當你讀到像保羅這樣聖潔的人，尚且必須克制身體，叫身服我，免得他傳福音給別人，自己反被棄絕（林前九25-27），你對自己的疏忽與屬肉體的生活有何感想？哦，不要活得好像肉體就是人，肉體的享樂就是你的幸福，而要活得像那些有靈魂需要照顧的人。
教義四：人的靈魂在身體死亡後依然存活；它不隨身體死亡。它沒有被消滅；它沒有分解到某種靈魂共同元素的本質中，從而失去了其特定的形式與名稱。被基督接納的依然是司提反的靈魂：它並不沉睡。反駁那些談論靈魂沉睡，或認為如此卓越、廣闊且活躍的本質會處於任何昏睡、無知或不活躍狀態的夢想，無異於與沉睡的人爭辯。當我們說它是不朽的，我們並非指它或任何受造物本身擁有自我支持或自我保存的充足性；或者它們是必然的存在，而非偶然的；或者它們是原始的存在，而非藉由創造從他者衍生而來。我們知道，如果上帝撤回祂保存與維繫的影響力，並暫停那延續它們的意志，整個世界瞬間就會化為烏有。祂不需要為它們的毀滅或消滅施加任何積極的意志或行動。雖然「創造者方能消滅」（ejusdem est annihilare, cujus est creare），除了上帝之外無人能消滅；但祂創造是藉由積極、有效的意志行動；而祂只需停止祂保存的意志行動，就能將其消滅。我並非指祂有任何改變，而是指祂只願意受造物延續到某個期限；然而，那位要使人的靈魂永存的上帝，賦予了它一種本性（正如祂賦予天使的一樣），使其適合被永存。這種本性不受構成與元素物質的影響，這些物質可能會使它受腐朽的支配。因此，正如鐵、銀或金在持續時間上比草、花或肉體更長久，這是有其本性上的原因（a natura rei），即在從屬於上帝意志的前提下，其本性具有這種持續的傾向；同樣地，靈魂的本性中也存在著這種不朽的傾向，上帝利用這種傾向來實現祂使其真正永存的旨意。
那些否認靈魂不朽的異教徒式索西尼派（Socinians）（甚至比異教徒更糟，因為大多數異教徒都堅持這一點），必須否認基督本人以及祂肢體的不朽；因為當祂在十字架上時，祂使用了與司提反此處向祂所用的一樣的託付方式，將靈魂交託給父。如果「主耶穌，接收我的靈魂」這句話不能證明司提反靈魂的存活；那麼，「父啊，我將我的靈魂交在祢手裡」也無法證明基督靈魂的存活。那麼，這些否認基督神性、進而使祂在身體進入墳墓時僅剩一具屍體的無神論者，將基督置於何地？那麼，祂如何兌現對那位悔改的強盜的應許：「今日你要同我在樂園裡了」？但那位說「因為我活著，你們也要活著」（約十四19）的主，在祂肉身被治死時，靈性卻活著（彼前三18）；並且在他們肉體在墳墓中腐爛時，接納祂僕人的靈魂進入永生。這段經文對此說得如此清楚，如果沒有其他經文，它也足以終結所有相信聖經之人的爭論。
我承認確實有一種靈魂的沉睡，即在罪與安逸中的隱喻性沉睡，否則這些無神論者的昏睡觀點就不會在世上找到立足之地；這種沉睡如此深沉，以至於上帝在祂話語的威脅中、在祂審判的警鐘中，以及祂最嚴肅的牧者所發出的警告雷聲中，都無法喚醒大多數人：一種如此死寂的沉睡佔據了大多數不敬虔的世界，以至於他們可以在上帝的注視下、在永恆的入口處、在地獄的門口，安然地犯罪，而上帝的呼喚卻無法喚醒他們：一種如此死寂的沉睡，以至於聖經公正地稱他們為死的（弗二1、5）；牧者們完全可以稱他們為死的，因為唉，我們的聲音無法喚醒他們；對我們而言，他們就像死人一樣：我們拉開窗簾讓光照進來，向他們展示審判即將來臨，並使用那些來自憤怒與地獄的真實卻可怕的論據——我們擔心這些論據會過度驚嚇許多柔弱的聽眾——然而他們依然沉睡；我們最響亮的呼喚、我們的淚水與懇求，都無法喚醒他們。我們奉主的名向他們呼喊：「你這睡著的人當醒過來，從死裡復活，基督就要光照你了。」（弗五14）。這種靈魂的道德沉睡與死亡，是永恆痛苦死亡的前奏，我們無法否認。但在死後，即使這種沉睡也將停止；上帝將以祂的報應喚醒那些不願被祂恩典喚醒的人。那麼，罪人啊，如果你能，就在思想罪與上帝的不悅中沉睡吧。地獄裡沒有沉睡的靈魂；那裡沒有人是失去知覺的。那使你的肉體在塵土中沉睡的死亡一擊，將一個有罪的靈魂釋放到一個沒有沉睡的世界；那裡有不可抗拒的光，以及將使他們保持清醒的恐怖與折磨。如果上帝藉由公義的火焰命令你醒來，祂絕不會容許拒絕。當你離開這肉體時，那將使你驚訝的第一眼與感受，將喚醒你進入永恆，並比我們在世時所能做的更多，並使你確信，對於分離的靈魂而言，沒有沉睡的狀態。